Journal of Ilam University of Medical Sciences

fa ارزیابی تأثیر جایگزینی اسید آمینه‌هایی با بار منفی کمتر در پپتید تترامر سنتتیک S3 مشتق از آمبوسیت خرچنگ نعل‌اسبی بر خاصیت ضد باکتریایی آن Evaluation of the Effect of Less Negatively Charged Amino Acid Substitution in Synthetic Tetramer Peptide S3 Derived from Horseshoe Crab Ambocyte on its Antibacterial Properties بیو شیمی بالینی clinical biochemistry پژوهشي Research مقدمه: بررسی آثار پپتیدهای دارای خاصیت ضد‌باکتریایی می‌تواند راه را برای به‌دست آوردن آنتی‌بیوتیک‌های مؤثرتر هموار سازد. در این تحقیق، پپتید تترامر Sushi3 طراحی و بیان شد؛ سپس با پپتید تترامر Sushi3 دیگری مطالعه و مقایسه گردید که به‌منظور تغییر خواص ضدباکتریایی، اسید آمینه‌های اسپارتیک اسید و پرولین آن با اسید آمینه‌های گلیسین و سرین جایگزین شده بودند. مواد و روش ها: ابتدا توالی‌های پپتیدی Sushi3 تترامر یادشده، طراحی و ساخته و به‌ترتیب Mer1 و Mer2 نام‌گذاری و به‌طور جداگانه در پلاسمید pET-26b(+) کلون گردید و درنهایت، به میزبان E.coli BL21(DE3)  انتقال داده شدند. پس از بیان پپتیدهای بالا، وجود پپتیدها با روش SDS-PAGE و وسترن بلات تأیید گردید؛ سپس فعالیت ضدمیکروبی Mer1 و Mer2 بررسی و مقایسه شد. درنهایت، سمیت دو تترامر ساخته‌شده بر روی ردۀ سلولی MDA-MB-231 ارزیابی و مقایسه گردید. یافته‌ها: Mer1 و Mer2 بیان پروتئینی مشابه داشتند و اثر سمی هر دو پپتید روی ردۀ سلولی تفاوت معنا‌داری نداشت؛ اما Mer2 نسبت به Mer1 ، در غلظت‌های یکسان، آثار ضدمیکروبی مؤثرتری دارد. بحث و نتیجه‌گیری: ارزیابی تأثیر جایگزینی اسید آمینه با بار منفی کمتر در افزایش فعالیت ضدمیکروبی پپتیدها، راهکار مناسبی است. نتایج بالا امکان طراحی و تولید پپتیدهای ضدمیکروبی علیه سویه‌های مقاوم به آنتی‌بیوتیک را به‌عنوان نسل بعدی آنتی‌بیوتیک‌ها افزایش می‌دهد. Introduction: The study of the effects of synthetic peptides with antibacterial properties can provide more effective antibiotics. This study designed, expressed, and investigated the Sushi 3 tetramer peptide. Subsequently, it was compared in terms of changing antibacterial properties with another Sushi3 tetramer peptide the aspartic acid and proline amino acids of which were replaced with glycine and serine amino acids. Material & Methods: First, the mentioned Sushi3 tetramer peptide sequences were designed, constructed, and named Mer1 and Mer 2, respectively, and cloned separately into plasmid pET-26b (+) and finally transferred to E.coli BL21 host (DE3). After the expression of the peptides, the presence of peptides was confirmed by SDS-PAGE and Western blotting. Afterward, the antimicrobial activity of Mer1 and Mer 2 was evaluated and compared. Finally, the toxicity of the two tetramers made on the MDA-MB-231 cell line was evaluated and compared. Findings: Mer1 and Mer 2 had similar protein expression, and the toxic effect of both peptides on the cell line was not significantly different. however, Mer 2 had more effective antimicrobial effects than Mer1 at the same concentrations. Discussion & Conclusion: Evaluation of the effect of amino acid replacement with less negatively charge on increasing the antimicrobial activity of peptides is a suitable strategy. The above results increase the possibility of designing and producing antimicrobial peptides against antibiotic-resistant strains as the next generation of antibiotics. پپتید تترامر Sushi3, خرچنگ نعل‌اسبی, فاکتور c, پپتیدهای ضدمیکروبی Antimicrobial peptides, Factor c, Horseshoe crab, Sushi3 tetramer peptide 103 116 http://sjimu.medilam.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-6208-3&slc_lang=fa&sid=1 Sakineh Baghbeheshti سکینه باغ بهشتی s.baghbeheshti@gmail.com 9600319475328460044987 9600319475328460044987 No Dept of Biology, Islamic Azad University, Science and Research Branch, Tehran, Iran گروه زیست‌شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران Shahin Hadadian شاهین حدادیان hadadian@yahoo.com 9600319475328460044988 9600319475328460044988 Yes Dept of Nanotechnology, Dept of New Technologies Research, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran گروه نانو بیوتکنولوژی، گروه تحقیقات فناوری ‌های نوین، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران Akram Eidi اکرم عیدی akram_eidi@yahoo.com 9600319475328460044989 9600319475328460044989 No Dept of Biology, Islamic Azad University, Science and Research Branch, Tehran, Iran گروه زیست‌شناسی، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران Leila Pishkar لیلا پیشکار leilapishkar@gmail.com 9600319475328460044990 9600319475328460044990 No Dept of Biology, Faculty of Sciences, Islamic Azad University, Islamshahr Branch, Islamshahr, Iran گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد اسلامشهر،اسلامشهر، ایران Hamzeh Rahimi حمزه رحیمی rahimi.hamzeh@genomefan.com 9600319475328460044991 9600319475328460044991 No Dept of Molecular Medicine, New Technologies Research Group, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran گروه پزشکی مولکولی، گروه تحقیقات فناوری‌ های نوین، انستیتو پاستور ایران، تهران، ایران