Journal of Ilam University of Medical Sciences
مجله دانشگاه علوم پزشکی ایلام
J. Ilam Uni. Med. Sci.
Medical Sciences
http://sjimu.medilam.ac.ir
96
journal96
1563-4728
2588-3135
doi
fa
jalali
1399
12
1
gregorian
2021
3
1
29
1
online
1
fulltext
fa
بررسی تغییرات سطوح بیانی ژنهای ATM، POLM، TP53 در بافت معدۀ بیماران
مبتلا به گاستریت و ارتباط آن با عفونت هلیکوباکتر پیلوری
Evaluation of Gene Expression Alterations of ATM, TP53, and
POLM in Gastric Biopsy Specimens of Patients with
Gastritis and its Association with Helicobacter
Pylori Infection
ژنتیک مولکولی
genetic mlvkly
پژوهشي
Research
<strong><em><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">مقدمه:</span></span></em></strong> <span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">گاستریت یا ورم معده، یکی از رایجترین بیماریهای درگیرکنندۀ معده است. عفونت با </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">Helicobacter pylori</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> میتواند به آسیبهای </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">DNA</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> و به دنبال آن، فعال شدن مسیرهای ترمیم </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">DNA</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> مستعد خطا منجر گردد که متعاقب آن، تجمع آسیبها در محل شکستهای دو رشتۀ </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">DNA</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> و تشدید بیثباتی ژنوم و تسهیل در</span></span> <span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">روند ایجاد سرطان معده میشود.</span></span> <span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">در این مطالعه، بیان ژنهای </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">ATM</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">POLM</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> و </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">TP53</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> که در سیستم ترمیم </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">DNA</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> و توقف چرخۀ سلولی نقش دارند، در مراحل پیشسرطانی معده بررسی گردید.</span></span><br>
<strong><em><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">مواد و روشها:</span></span></em></strong> <span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">از 180 نمونۀ بیوپسی جمعآوریشده، 30 نمونه که گاستریت مزمن متوسط آلوده با هلیکوباکتر پیلوری داشتند، بهعنوان گروه مورد و 30 نمونه دیگر که گاستریت مزمن خفیف بدون آلودگی با هلیکوباکتر پیلوری داشتند، بهعنوان گروه شاهد در نظر گرفته شدند. پس از استخراج </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">RNA</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، ساخت </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">cDNA</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> انجام و بیان ژنهای </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">ATM</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">POLM</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> و </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">TP53</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> با روش </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">Real Time PCR</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> در دو گروه سنجیده گردید.</span></span><br>
<strong><em><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">یافتههای پژوهش:</span></span></em></strong><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:13.0pt;"> ژ</span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">نهای </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">ATM</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">،</span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> POLM </span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">و </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">TP53</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> در گروه مورد نسبت به گروه شاهد، به ترتیب 07/4، 35/3 و 13/5 افزایش</span></span> <span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">بیان در سطح نسخهبرداری را نشان دادند.</span></span><br>
<strong><em><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">بحث و نتیجهگیری:</span></span></em></strong> <span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">درمجموع، ژنهای </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">ATM</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">POLM</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> و </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">TP53</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> بیان بالاتری را در گروه مورد نسبت به گروه شاهد نشان دادند که ممکن است بیانگر فعال شدن این ژنها پس از عفونت هلیکوباکتر پیلوری و به دنبال آن، فعال شدن مسیر ترمیم </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">DNA</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> مستعد خطا و نوترکیبی غیرهومولوگ شود.</span></span>
<em>Introduction:</em> Gastritis is one of the most common diseases affecting the stomach. Helicobacter pylori infection could lead to DNA damage in gastric epithelial cells, followed by error-prone DNA repair pathways that increase the accumulation of damage at the site of DNA double-stranded breaks, exacerbate genome instability, and facilitate the emergence of gastric cancer. This study aimed to examine the expression level of ATM, POLM, and TP53 genes involving in the DNA Damage Response and the cell cycle arrest in the gastric precancerous stage.<br>
<br>
<em>Materials & Methods:</em> Among 180 gastric biopsy specimens, 30 samples taken from patients with moderate chronic gastritis infected by H. Pylori were regarded as the case group, and 30 other samples taken from non-infected patients with mild chronic gastritis were regarded as control. Following that, RNA extraction and cDNA synthesis was performed. Afterward, the expression levels of ATM, POLM, and TP53 genes were evaluated by the Real-Time PCR method.<br>
<em>Ethics code:</em> 98-02-27-43392<br>
<br>
<em>Findings:</em> The ATM, POLM, and TP53 genes in the cases showed a 4.07, 3.35, and 5.13 increase in the gene expression at the transcriptional level, compared to the controls.<br>
<br>
<em>Discussion & Conclusions: </em>In general, ATM, POLM, and TP53 genes showed a higher increased expression level in the case group, compared to the controls, which might indicate the activation of noted genes after H. pylori infection. This may subsequently activate the error-prone DNA repair and non-homologous recombination pathways.
گاستریت, هلیکوباکتر پیلوری, شکستهای دو رشتۀ DNA, ATM, POLM, TP53
ATM, POLM, TP53 genes, DNA double stranded breaks, Gastritis, H. pylori
87
95
http://sjimu.medilam.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-6289-1&slc_lang=fa&sid=1
Armin
Ghameshloo
آرمین
قامشلو
9600319475328460043278
9600319475328460043278
No
Dept of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran
گروه ژنتیک، دانشکده علوم پایه، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد علوم و تحقیقات، تهران، ایران
Ali
Rashidi-nezhad
علی
رشیدی نژاد
arashidinezhad@tums.ac.ir
9600319475328460043277
9600319475328460043277
Yes
Maternal, Fetal and Neonatal Research Center, Imam Khomeini Hospital Complex, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran
مرکز تحقیقات مادر، جنین و نوزاد، مجتمع بیمارستانی امام خمینی (ره)، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران
Masoud
Alebouyeh
مسعود
آل بویه
9600319475328460043279
9600319475328460043279
No
Pediatric Infections Research Center, Research Institute for Children's Health, Shahid Beheshti University of Medical Sciences, Tehran, Iran
مرکز تحقیقات عفونی اطفال، پژوهشکده سلامت کودکان، دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی، تهران، ایران
Abas
Shakouri
عباس
شکوری
9600319475328460043280
9600319475328460043280
No
Genetic Ward, Imam Khomeini Hospital Complex, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran
بخش ژنتیک، مجتمع بیمارستانی امام خمینی (ره)، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران