fa بررسی پلی‌مورفیسم ژنومی تریکوفیتون روبروم (Trichophyton rubrum) جداشده از منابع بالینی کراتینیزه با روش RAPD_PCR قارچ شناسي mycology پژوهشي Research <strong><em><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">مقدمه:</span></span></em></strong> <span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">درماتوفیتوزیس عارضۀ قارچی بافت‌های کراتینیزه پوست، مو و ناخن است که درنتیجۀ استقرار درماتوفیت در نسوج روی می‌‌دهد. اقدام به تایپینگ و افتراق زیرگونه‌‌ها و مطالعۀ ارتباط احتمالی گونه‌های خاص با اشکال بالینی جدایه‌</span></span> <span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">تریکوفیتون، با استفاده از روش </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">RAPD-PCR</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، با کمک پرایمرهای تصادفی است که ابزار سودمندی برای تیپ</span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">‌</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">بندی و تمایز گونه‌های قارچی به‌شمار می‌رود. هدف از این پژوهش، بررسی پلی‌مورفیسم ژنومی تریکوفیتون روبروم جداشده از منابع کراتینیزه با روش </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">RAPD_PCR</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> است.</span></span><br> <strong><em><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">مواد و روش‌ها:</span></span></em></strong> <span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">در این مطالعه، 60 نمونه درماتوفیتوزیس از بیماران پوستی در سنین 12 تا 45 سال، از بیمارستان خاتم‌الانبیا استان تهران و بیمارستان قدس استان مرکزی جداسازی شدند. نمونه‌ها در محیط سابورو دکستروز آگار یا محیط میکروبیوتیک آگار تلقیح گردیدند. درمجموع، 30 نمونه مثبت (+) به</span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">‌</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">دست آمد. برای استخراج </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">DNA</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> تریکوفیتون روبروم، از کیت اختصاصی استفاده شد. آزمون </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">PCR</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> با استفاده از پرایمرهای اختصاصی صورت گرفت و از روش</span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> RAPD_ PCR</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">برای بررسی ژنومی آن‌ها استفاده گردید. بررسی پلی‌مورفیسم ژنوم، شاخص ژنتیکی ارزشمندی در ارزیابی ساختار ژنوم تریکوفیتون روبروم است.</span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;"></span></span></span><br> <strong><em><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">یافته‌های پژوهش:</span></span></em></strong> <span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">از غربالگری نمونه‌های بالینی آزمایشگاه که بر اساس ویژگی‌های مورفولوژیک، میکروسکوپی و تست‌‌‌‌های بیوشیمیایی تعیین هویت شدند، درمجموع 30 جدایه تریکوفیتون روبروم جدا گردید</span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">.</span></span></span><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> این سویه‌‌ها در 9 گروه مجزا دسته‌بندی شد که هرکدام از سویه‌ها صفات فنوتیپی و ژنوتیپی مشترک دارند. در میان کلاسترهای مشخص‌شده، بیشترین فراوانی مربوط به کلاستر 9 است که 12 ایزوله با ویژگی‌های خویشاوندی مشترک را در برمی‌گیرد.</span></span><br> <strong><em><span dir="RTL"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">&nbsp;بحث و نتیجه‌گیری:</span></span></span></em></strong> <span dir="RTL"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">بررسی پلی‌مورفیسم ژنومی تریکوفیتون روبروم جداشده از نمونه‌های درماتوفیتی افراد مبتلا به درماتوفیتوزیس در منطقۀ جغرافیایی تهران، با تکنیک </span></span></span><span style="font-family:Times New Roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">RAPD_ PCR </span></span><span dir="RTL"><span style="font-family:B Mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، به‌وسیلۀ پرایمر اختصاصی پرداخته شد که در این مطالعه، بعد مسافت و متغیر گروه سنی تأثیر بسزایی داشتند. تنوع ژنتیکی می‌‌تواند در انتقال و بیماری‌زایی تریکوفیتون روبروم نقش ویژه‌ای داشته باشد.</span></span></span> <em>Introduction: </em>Dermatophytosis is a fungal complication of keratinized skin, hair, and nail tissues, which is caused by the establishment of dermatophytosis in the tissues. Attempts for tapping and discriminating the subtypes, as well as studying the possible association of specific species with clinical forms of trichophyton isolates using RAPD-PCR with random primers is a useful tool for typing and differentiating the fungal species. This study aimed to investigate the genomic polymorphism of Trichophyton rubrum isolated from keratinized sources using the RAPD-PCR method.<br> &nbsp;<br> <em>Materials & Methods:</em> In this study, 60 dermatophytosis specimens were isolated from dermatophilic patients aged 12 to 45 years referred to Khatam-al-Anbia Hospital in Tehran province and Qods Hospital in Markazi province, Iran. The samples were inoculated in Sabourodextrose agar or microbial agar medium. A total of 30 positive samples were obtained, and specific kits were used to extract trichophyton rubrum DNA. The PCR was performed using specific primers, and the RAPD-PCR method was employed for genomic analysis. Investigation of genomic polymorphism is a valuable genetic marker in the evaluation of genome structure of Trichophyton rubrum.<br> &nbsp;<br> <em>Findings:</em> A total of 30 isolates of Trichophyton rubrum were isolated after screening the clinical specimens that were identified based on morphological, microscopic, and biochemical tests. These strains were divided into nine genomic groups, some of which were found in several groups, indicating the genotypic similarity of the fungi of the same species at different locations. Among the identified clusters, cluster nine obtained the highest frequency, which included 12 isolates with common kinship characteristics.<br> &nbsp;<br> <em>Discussions & Conclusions:</em> This study investigated the genomic polymorphism of Trichophyton rubrum isolated from dermatophytes specimens of patients with dermatophytosis in Tehran, Iran, using the RAPD-PCR technique with a primer. According to the results, distance and age group had a significant effect. Furthermore, genetic diversity can play a special role in the transmission and pathogenicity of this microorganism. تریکوفیتون روبروم, درماتوفیتوزیس, پلی‌مورفیسم ژنومی, RAPD_ PCR Dermatophytosis, Genomic polymorphism, Trichophyton rubrum, RAPD-PCR 39 49 http://sjimu.medilam.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3283-4&slc_lang=fa&sid=1 kumarss amini کیومرث امینی dr_kumarss_amini@yahoo.com 9600319475328460043191 9600319475328460043191 No Dept of Microbiology, Faculty of Basic Sciences, Saveh Branch, Islamic Azad University, Saveh, Iran گروه میکروبیولوژی، دانشکده علوم پایه، واحد ساوه، دانشگاه آزاد اسلامی، ساوه، ایران shima chehreii شیما چهرئئ Sh-chehreii@yahoo.com 9600319475328460043192 9600319475328460043192 Yes Dept of Microbiology, Faculty of Basic Sciences, Arak Branch, Islamic Azad University, Arak, Iran گروه بیولوژی، دانشکده علوم پایه، واحد اراک، دانشگاه آزاد اسلامی، اراک، ایران parisa malekabadi پریسا مالک ابادی malekabadiparisa@yaghoo.com 9600319475328460043193 0000000232429253 No Dept of Microbiology, Faculty of Basic Sciences, Arak Branch, Islamic Azad University, Arak, Iran گروه بیولوژی، دانشکده علوم پایه، واحد اراک، دانشگاه آزاد اسلامی، اراک، ایران