Journal of Ilam University of Medical Sciences

fa شناسایی و جداسازی ژن‌ کدکننده‌ یک انتروسین از سویه‌ های انتروکوکوس فاسیوم Enterococcus faecium ) ) جداسازی شده از شیره بلوط Identification and Isolation of an Enterocin Encoding Gene from an Enterococcus faecium Strain LUB950217 Isolated from Oak Tree Sap كاربردي Applicable مقدمه: باکتری های اسیدلاکتیک(LAB)، گروهی از باکتری های گرم مثبت، بدون اسپور، کروی یا میله ای شکل و کاتالاز منفی هستند که عموماً به‌ عنوان ارگانیسم های ایمن در نظر گرفته می شوند. این باکتری ها دارای توانایی تولید تغییرات مطلوب در طعم و بافت غذا می باشند. انتروکوک ها باکتری های اسیدلاکتیکی با توانایی تولید پپتیدهای ضدمیکروبی(باکتریوسین ها) می باشند. مواد و روش ها: به منظور، شناسایی و جداسازی ژن کدکننده و پپتید مربوطه از سویه های انتروکوکوس فاسیوم شیره بلوط، یک مطالعه ای تجربی صورت گرفت. برای این منظور، استخراج DNA از باکتری انتروکوکوس فاسیوم سویه LUB950217 صورت گرفت. واکنش PCR با استفاده از آغازگرهای هرز انجام گرفت و پس از خالص سازی محصول PCR، توالی سنجی صورت گرفت. آنالیزهای بیوانفورمانیکی صورت گرفت و توالی پروتئین مدل سازی شد. یافته های پژوهش: پس از انجام توالی یابی و مقایسه هم ‌ردیفی، پپتیدی با 36 اسیدآمینه و وزن مولکولی 28/4658 دالتون شناسایی شد. میزان شباهت این پپتید با باکتریوسین های شناخته شده از 100-86 متغیر بود. پپتید شناسایی شده به شدت کاتیونی(2/2 در 7pH=) بود. بحث و نتیجه گیری: انتروسین مربوط به انتروکوکوس فاسیوم سویه LUB950217 دارای طیف مهارکنندگی رشد بر روی باکتری های گرم مثبت و گرم منفی می باشد. بنا بر این این سویه از باکتری پتانسیل بالایی جهت بررسی و استفاده به عنوان، نگه ‌دارنده ‌های زیستی در صنایع غذایی و خوراک دام دارد. به علاوه، جـــداسازی، همسانه سازی و بیان ژن کدکننده این پپتید در گیاهان زراعی ممکن است بتواند گـــیاهان را به بیماری های قارچی و میکروبی مقاوم کند.   Introduction: Lactic acid bacteria )LAB) are a group of gram-positive, non-spore forming, cocci or rod shaped, catalase-negative organisms, which are generally recognized as safe (GRAS). The LAB can cause changes in the food flavor and texture. Enterococci are a group of LAB capable of producing antimicrobial peptides.   Materials & Methods: This experimental study was conducted to identify and isolate genes encoding antimicrobial peptides from an E. faecium LUB950217 strains isolated from oak tree. In doing so, genomic DNA was extracted from E. faecium strains and polymerase chain reaction (PCR) analysis was performed using specific primers. Amplified PCR products were sequenced by Sanger sequencing. Bioinformatic analysis was carried out and the peptide was modeled. Findings: Both DNA and protein Blast search confirmed that the PCR product encoded an antimicrobial peptide, known as LUB950217 enterocin with 36 amino acids of 4658.28 Da molecular mass. The isolated enterocin peptide had 86-100% similarity to other known enterocins in the peptide data bases. The LUB950217 enterocin was almost water insoluble and it was found to be cationic (2.2, pH=7).   Discussion & Conclusions: The LUB950217 enterocin seems to inhibit both gram-positive and gram-negative bacteria growth in vitro, suggesting LUB950217 enterocin can be used in food stuff and animal feed. Furthermore, isolation, cloning, and expression of this peptide may render resistance to fungi and bacteria pathogens in crop plants. انتروکوکوس فاسیوم, PCR, باکتریوسین, انتروسین A Enterococcus faecium, PCR, Bacteriocin, Entrocin A 180 188 http://sjimu.medilam.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3681-1&slc_lang=fa&sid=1 Sedighe Falamarzi monfared صدیقه فلامرزی منفرد Monfaredsara01@gmail.com 9600319475328460037892 9600319475328460037892 No Dept of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم ‌آباد، ایران Farhad Nazariyan Firuozabadi فرهاد نظریان فیروزابادی Nazarian.f@lu.ac.ir 9600319475328460037893 9600319475328460037893 Yes Dept of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم ‌آباد، ایران Ahmad Ismaili احمد اسماعیلی Ahmad_ismaili@yahoo.com 9600319475328460037894 9600319475328460037894 No Dept of Agronomy and Plant Breeding, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم ‌آباد، ایران