Journal of Ilam University of Medical Sciences
مجله دانشگاه علوم پزشکی ایلام
J. Ilam Uni. Med. Sci.
Medical Sciences
http://sjimu.medilam.ac.ir
96
journal96
1563-4728
2588-3135
doi
fa
jalali
1397
8
1
gregorian
2018
11
1
26
4
online
1
fulltext
fa
بررسی خصوصیات فیلوژنتیکی باکتری اندوفیت سودوموناس پروتجنس با توانایی تولید ترکیبات آنتاگونیستی جدا شده از گیاه برگ نو
Phylogenetic Characterization oF Endophytic Bacterium Pseudomonas Protegens with Antagonistic Ability Isolated From privet
باکتری شناسی
Bacteriology
پژوهشي
Research
<p dir="RTL"><strong><em><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">مقدمه:</span></span></em></strong> <span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">باکتری های اندوفیت با توانائی تولید ترکیبات آنتاگونیست، قادر به کنترل بیمارگرهای گیاهی هستند. این مطالعه به منظور بررسی توانایی تولید ترکیبات آنتاگونیستی در باکتری های اندوفیت برگ نو انجام پذیرفته است. </span></span><br>
<strong><em><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">مواد و روش ها:</span></span></em></strong> <span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">در این پژوهش باکتری های اندوفیت از برگ و شاخه برگ نو، جداسازی گردید، پس از استخراج </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">DNA</span></span></span><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> ژنومی، از روش </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">PCR</span></span></span><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> به منظور تکثیر ژن </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">16S rDNA</span></span></span><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> استفاده گردید. به منظور شناسایی دقیق باکتری جداسازی شده، محــــصول </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">PCR</span></span></span><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">، تعیـــین توالی و تـــرادف بازی </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">16S rDNA</span></span></span> <span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">BLAST</span></span></span><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> گردید. جدایه ها از نظر تولید سیدروفور، هیدروژن سیانید و آنزیم پروتئاز مورد بررسی قرار گرفتند. </span></span><br>
<strong><em><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">یافته های پژوهش:</span></span></em></strong> <span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">تمام باکتری های جداسازی شده در این پژوهش قادر به تولید آنزیم پروتئاز بودند. تنها یک سویه قادر به تولید هیدروژن سیانید بود(</span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">BN3</span></span></span><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">). نتایج آزمون سیدروفور برای یک سویه مثبت بود(</span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;">BN2</span></span></span><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">). نتایج تعیین توالی نشان داد که باکتری های جداسازی شده متعلق به سودوموناس پروتوجنس </span></span><span dir="LTR"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:8.0pt;"> Pseudomonas protegens</span></span></span><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;"> است که با سویه تیپ شباهت 100 درصدی دارد.</span></span><br>
<strong><em><span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">بحث و نتیجه گیری:</span></span></em></strong> <span style="font-family:b mitra;"><span style="font-size:10.0pt;">سویه های جدا شده در این پژوهش، می توانند در افزایش رشد گیاه بهکار روند. از آن جا که کشاورزی پایدار به توانائی حفظ تولید، همراه با استمرار نگه داشت منابع و حفظ محیط زیست تاکید دارد، لذا کاربرد باکتری های اندوفیت در راستای اهداف کشاورزی پایدار است و بی شک با شناخت و کشف مکانیزم های دخیل می توان به این مهم دست یافت.</span></span></p>
<p dir="RTL"></p><p dir="RTL"></p><p dir="RTL"></p>
<p style="text-align: justify;"><em>Introduction:</em> Endophytic bacteria are able to control plant pathogens by producing antagonistic compounds. This research was conducted to determine the antagonistic ability of bacterial endophytes in privet (Ligustrum vulgare L.).<br>
<br>
<em>Materials & Methods:</em> In this study, endophytic bacteria were isolated from stem and leaf of privet (Ligustrum vulgare L.). After genomic DNA extraction, 16S rDNA gene was amplified using polymerase chain reaction (PCR) technique for precise bacterial identification. Then, the PCR product was sequenced by BLAST. Strains were examined for siderophore, hydrogen cyanide, and protease tests<span dir="RTL">. </span><br>
<br>
<em>Findings:</em> All the isolated bacteria were able to produce protease. Only one strain (BN3) was able to produce hydrogen cyanide. The siderophore test was positive for one strain (BN2). Based on the 16S rDNA sequence studies, the strain bacteria belonged to Pseudomonas protegens and indicated 100% similarity to type strain<span dir="RTL">. </span><br>
<br>
<em>Discussion & Conclusions:</em> The endophytic bacteria isolated in this study can be used to promote plant growth. Knowledge about endophytic bacteria-plant interaction can provide an effective strategy to develop sustainable agriculture in order to ensure yield improvement without affecting environment<span dir="RTL">.</span></p>
<p align="center" dir="RTL"></p>
<div dir="ltr" style="text-align: justify;"></div>
<p align="right" dir="RTL"></p><p dir="RTL"></p><p align="right" dir="RTL"></p>
اندوفیت, باکتری, برگ نو, سیدروفور
Bacteria, Endophytic, Privet, Siderophore
74
84
http://sjimu.medilam.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-3446-1&slc_lang=fa&sid=1
Faegheh
Etminani
فایقه
اطمینانی
agriculture.student@yahoo.com
9600319475328460037183
9600319475328460037183
Yes
Young Researchers and Elite Club Islamic Azad University, Sanandaj Branch, Sanandaj,Iran
باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد سنندج، سنندج، ایران
Adibeh
Etminani
ادیبه
اطمینانی
student.agronomy@yahoo.com
9600319475328460037184
9600319475328460037184
No
Young Researchers and Elite Club Islamic Azad University, Sanandaj Branch, Sanandaj,Iran
باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان، دانشگاه آزاد اسلامی، واحد سنندج، سنندج، ایران