fa طراحی مهارکننده دارویی آنزیم سیکلو اکسیژناز 2 جهت کاهش التهاب و درد زیست شناسی biology پژوهشي Research <p dir="RTL"><strong><em>مقدمه:</em></strong> در مطالعه پیش رو، به منظور کاهش عوارض جانبی داروهای ضد التهابی و افزایش اختصاصیت آن ها، از طریق زیست شناسی محاسباتی و دانش بیوانفورماتیک، مهارکننده دارویی جدیدی طراحی شد.</p> <p dir="RTL"><strong><em>مواد و روش ها:</em></strong> به این منظور ابتدا 150000 ترکیب با خاصیت دارویی از پایگاه داده&nbsp;<span dir="LTR">ZINC</span>&nbsp;و هم چنین فایل مربوط به ساختار آنزیم سیکلواکسیژناز 2، از پایگاه داده(<span dir="LTR">Research Collaboratory for Structural Bioinformatics</span>)&nbsp;<span dir="LTR">RCSB</span>&nbsp;استخراج شدند. پس از آماده سازی آن ها، تمام این ترکیبات شیمیایی با آنزیم مورد نظر به منظور انتخاب بهترین مهارکننده دارویی(لیگاند)، داک شدند.</p> <p dir="RTL"><strong><em>یافته های پژوهش:</em></strong> پس از بررسی محاسبات،10 ترکیب از لیگاندهایی که حاصل عمل داکینگ&nbsp;بودند، بر اساس انرژی آزاد گیبس(کمترین<span dir="LTR">&Delta;G </span>) انتخاب شدند. بر اساس نتایج به دست آمده از عمل داکینگ، اتصال مهارکننده به آنزیم سیکلواکسیژناز 2، موجب تغییر کنفورماسیونی آنزیم، کاهش انرژی پتانسیل و افزایش پایداری کمپلکس مهارکننده-آنزیم شد.</p> <p dir="RTL"><strong><em>بحث و نتیجه گیری:</em></strong> با توجه به نتایج به دست آمده در این تحقیق، ترکیبات می توانند با قرارگیری در جایگاه فعال آنزیم، التهاب و درد را در بیماری های مختلف التهابی، بر اساس اختصاصیت بیشتر و در نهایت توکسیسیتی کمتر، کاهش دهند<span dir="LTR">.</span></p> <p><em>Introduction</em>: In the current study, to reduce the side effects of anti-inflammatory drugs and increase their specificity, a new pharmaceutical inhibitor was designed by computational Biology and Bioinformatics knowledge.</p> <p></p> <p><em>Materials & methods</em>: For this purpose, first, 150000 compounds with medicinal properties from ZINC database and also the files related to the structure of the enzyme cyclooxygenase2 from RCSB (Research Collaboratory for Structural Bioinformatics) were extracted. After preparing them, all of these chemical compounds were docked with the target enzyme in order to select the best pharmaceutical inhibitor (ligand).</p> <p></p> <p><em>Findings</em>: After checking the computation, 10 compounds of ligands that were the results of Docking, were selected according to the Gibbs free energy (least &Delta;G). Based on the results of the docking operation, inhibitor binding to cox2 causes conformational changes of enzyme, potential energy reduction, and increasing the stability of inhibitor-enzyme complex.</p> <p></p> <p><em>Discussion & conclusions</em>: According to the results obtained from the study, the inhibitors can reduce the inflammation and pain in different inflammatory diseases, by placing in the active site on the basis of more specificity and finally less toxicity.</p> <p></p> سیکلواکسیژناز 2, داکینگ مولکولی, داروهای ضد التهاب غیر استروئیدی, غربالگری مجازی, دینامیک مولکولی Cyclooxygenase2, Molecular docking, Nonsteroidal anti-inflammatory drug, Virtual screening, molecular dynamics 203 212 http://sjimu.medilam.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-2944-1&slc_lang=fa&sid=1 Pouyan Asadi پویان اسدی cellchem2016@gmail.com 9600319475328460034911 9600319475328460034911 Yes Young Researchers and Elite Club, Gorgan Branch, Islamic Azad University, Gorgan, Iran باشگاه پژوهشگران جوان و نخبگان، واحد گرگان، دانشگاه آزاد اسلامی، گرگان، ایران Elahe Alivaisi الهه علی ویسی elahe_13856@yahoo.com 9600319475328460034912 9600319475328460034912 No Dept of Clinical Biochemistry, Faculty of Medicine, Ilam University of Medical Sciences, Ilam, Iran گروه شیمی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه پیام نور مرکز بهشهر، بهشهر، ایران Nazanin Norollahi moghadam نازنین نوراللهی مقدم N.NMoghadam@gmail.com 9600319475328460034913 9600319475328460034913 No Dept of Chemistry, Faculty of Science, University of Payam Noor Behshahr, Behshahr, Iran گروه شیمی دانشکده علوم پایه، دانشگاه پیام نور مرکز بهشهر