fa بررسی کموانفورماتیکی و اندازه گیری فعالیت آزمایشگاهی لیگاندهای ممانعت کننده آنزیم سیکلواکسیژناز دو Cox2 انسانی بیوشیمی biochemistry پژوهشي Research <div align="right" style="direction: rtl">مقدمه: مهار‌کننده‌ های انتخابی آنزیم سیکلو‌اکسیژناز دو، نظیر سلوکو‌کسیب، روفوکوکسیب و والدوکسیب اخیراً به عنوان کاهنده‌ های پاسخ‌ های التهابی به کار می ‌روند، با وجود این هنوز به مطالعات و تحقیقات بیشتری در زمینه مهار‌کننده‌ های انتخابی Cox2 نیاز است. این مطالعه در راستای معرفی ساختار‌های جدید با میل تر‌کیبی بیشتر به آنزیم Cox2 می ‌‌‌باشد.<br> مواد و روش ها: سا‌ختار‌های شیمیا‌یی با 80 درصد شباهت به سلو‌کو‌کسیب، از Pubchem در پایگاه اطلاعا‌تی NCBI استخراج و جمع ‌‌آوری شد. فایل PDB آنزیم Cox2 (6COX) را د‌ر حا‌لت پیوند با لیگا‌ند SC-558 به عنوان لیگاند مرجع، از سایت RCSB PDB به دست آمد. د‌اکینگ لیگا‌ند‌ها به جایگاه اتصال SC-558 را با استفاد‌ه از نرم افزار FlexX, Lead IT اجرا شد و انرژی میان کنش‌ های بین ترکیبات مختلف به دست آمد. مقدار IC50 ترکیبات مورد نظر با استفاده از روش غربالگری آزمایشگاهی، بر علیه آنزیم Cox2 تعیین شد. سرانجام با استفاده از روش سنجش MTT‌، میزان سمیت سلولی ترکیبات مورد نظر تعیین شد.<br> یافته های پژوهش: نتیجه غربالگری در پایگاه داده Pubchem، 5000 مولکول مشابه سلوکوکسیب بود. 24 تا از ترکیبات امتیاز‌های انرژی بهتری نسبت به 6COX باند شده با SC-558 داشتند. لیگاند‌ها به پاکت پیو‌ند‌ی داک شد‌‌ند که با سرین 353، آلانین 527، وا‌لین 523، متیونین 522، فنیل آلانین 518 و لوسین 352 میان کنش نشان د‌اد‌ند. با بررسی چشمی، ترکیبات جهتگیری و حالت پیوندی مشابه با SC-558 نشان داد‌‌ند.<br> &nbsp;بحث و نتیجه گیری: یافته ‌های ما، رویه محاسباتی کشف ترکیبات جدید ضدالتهابی با فعالیت بیشتر و سمیت کمتر نسبت به مهارکننده‌ های عمومی Cox2 را قوت بخشید.</div> <p>Introduction: Cox2 selective inhibitors such as celecoxib, rofecoxib and valdecoxib are recently used to reduce inflammatory response. There is still a need to develop more potent Cox2 inhibitors. This study was conducted to introduce new structures with more affinity to Cox2 enzyme.<br> &nbsp;Materials & methods: Chemical structures with 80% similarity to celecoxib was collected by using PubChem at NCBI database. The PDB file of Cox2 enzyme (6COX) obtained from RCSB PDB website in bounding with ligand SC-558 as reference ligand. Docking of ligands to SC-558 site of Cox2 performed with lead IT software (version 2.1.0 BioSolveIT, GmbH, Germany) and the interaction energy of different compounds was obtained. IC50 value of selected compounds identified by using in vitro screening against Cox2 enzyme. The cytotoxicity assay was performed by using MTT method.<br> &nbsp;Findings: Screening results in PubChem database was 5000 molecules similar to celecoxib. 24 compounds had better energy scores than 6COX bound co-crystallized ligand SC-558.The ligands were docked with the binding pocket that they showed interaction with Leu352, Phe518,Met522, Val523, Ala527 and Ser353. By visual inspection, compounds showed orientation and hybrid mode similar to SC-558. Discussion & Conclusion: our findings strengthened the computational procedure the discovery of new compounds with anti-inflammatory activity and less toxicity than Cox2 general inhibitors.</p> آنزیم سیکلو‌اکسیژناز دو, مهار‌کننده انتخابی سیکلو‌اکسیژناز دو, داکینگ, روش سنجش MTT Cox2, Cox2 selective inhibitors, Docking, MTT method 97 108 http://sjimu.medilam.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1524-3&slc_lang=fa&sid=1 seyd Fatemeh Mousavi سیده فاطمه موسوی 9600319475328460024956 9600319475328460024956 No Islamic Azad University, Sanandaj Branch دانشگاه آزاد اسلامی، واحد سنندج Ali Ramezani علی رمضانی 9600319475328460024957 9600319475328460024957 No Zanjan University of Medical Sciences دانشگاه علوم پزشکی زنجان Parviz Ashtari پرویز اشتری 9600319475328460024958 9600319475328460024958 No Nuclear Science and Technology Research Institute پژوهشگاه علوم و فنون هسته‌ای Fatemeh keshavarzi فاطمه کشاورزی gol.keshavarzi@gmail.com 9600319475328460024959 9600319475328460024959 Yes 1Department oIslamic Azad University, Sanandaj Branch دانشگاه آزاد اسلامی، واحد سنندج