Journal of Ilam University of Medical Sciences
مجله دانشگاه علوم پزشکی ایلام
J. Ilam Uni. Med. Sci.
Medical Sciences
http://sjimu.medilam.ac.ir
96
journal96
1563-4728
2588-3135
doi
fa
jalali
1388
7
1
gregorian
2009
10
1
17
3
online
1
fulltext
fa
تاثیر نوع میکرو فیلتر در تشخیص کلی فرم از آب آشامیدنی با استفاده از روش PCR
Effects of Micro-filter in Detection of Coliform in Tap Water by PCR
عمومى
General
پژوهشي
Research
مقدمه: استفاده از روش های معمول تشخیص عوامل میکروبی آب اغلب با حساسیت کم و مستلزم صرف وقت زیادی می باشند. از مزایای روش های مولکولی از جمله PCR بالا بودن حساسیت، دقت، سرعت و هزینه نسبتا پایین آن است. برای انجام آزمایش PCR جهت تشخیص آلودگی آب به E.coli لازم است از روش تغلیظ نمونه ها با میکرو فیلتر استفاده شود. در این تحقیق سعی شده با بررسی دو نوع میکرو فیلتر نقش آن ها را در کارآیی PCR تعیین شود. مواد و روش ها : رقت های 100/ 8 ، 100/4 ، 100/2 ، 100/1 ، 200/1 ، 400/1 ، 800/1 ، 1600/1 ، از باکتری در آب مقطر تهیه و به روش فیلتراسیون با دو نوع فیلتر FHLP و HAWP باکتری از نمونه جدا گردید. سپس تکثیر ژن 16sRNA با استفاده از روش PCR و به کمک پرایمرهای طراحی شده انجام گرفت. یافته های پژوهش: کشت رقت های تهیه شده نشان دهنده تأیید تعداد باکتری ها در این رقت ها بود. نتیجه PCR رقت ها پس از فیلتراسیون نشان داد که فیلترهایFHLP توانایی بالاتری نسبت به فیلترهای HAWP در جــدا سازی باکتری ها دارند. چنانچه در رقت های پایین باکتری نتیجه PCR مثبت بود. بحث و نتیجه گیری: نتایج به دست آمده از این بررسی حاکی از آن است که فیلترهای هیدروفوبیک (نظیر FHLP) قدرت بیشتری از فیلترهای هیدروفیلیک در جذب باکتری ها دارند. لذا استفاده از فیلترهای هیدروفیلیک در تشخیص باکتری با استفاده از روش های حساسی نظیر PCR اغلب باعث بروز نتایج منفی کاذب می شود.
Introduction: For detection of E.coli in top water by PCR, the samples must be concentrated by filter. In this study, we investigated two kinds of micro filters in PCR results. Materials & Methods: After preparing dilution of E.coli (8/100, 4/100, 2/100, 1/100, 1/200, 1/400, 1/800 and 1/1600) in D.W, the bacteria were separated by FHLP and HAWP filters and 16s rRNA was propagated by the above- mentioned primers. Findings: The rate of bacteria in dilutions was confirmed by culture. The PCR data showed that FHLP, better than HAWP filter, would be able to separate the bacteria in such dilutions after filtration. Discussion & Conclusion: The results of this study showed that hydrophobic filter (FHLP) has a higher ability than that of hydrophilic filter (HAWP) in separating bacteria. So, successful PCR amplifications were achieved by cells concentrated with hydrophobic filters for detection of all the coliform bacteria, while false negative results decreased considerably.
کلی فرم, واکنش زنجیره ای پلیمرآز, میکروفیلتر
coliform, PCR, microfilter
10
15
http://sjimu.medilam.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-1-99&slc_lang=fa&sid=1
hamid
Abtahi
حمید
ابطحی
9600319475328460019471
9600319475328460019471
Yes