TY - JOUR JF - sjimu JO - J. Ilam Uni. Med. Sci. VL - 30 IS - 1 PY - 2022 Y1 - 2022/3/01 TI - Bioinformatic Prediction of Non-Coding Genes related to the Mouse FGF8, NOG, and BMP4 Ectodermal Differentiation Pathway Genes and Mapping of Related Network TT - پیشگویی بیوانفورماتیکی ژن‌های غیرکدکنندۀ مرتبط با ژن‌های مسیر تمایز اکتودرمی FGF8، NOG و BMP4 موشی و ترسیم شبکۀ ارتباطی آن‌ها N2 - مقدمه: lncRNAها و miRNAها دسته‌ای از RNAهای غیرکدکننده هستند که نقش و عملکردهای مهمی در تنظیم بیان ژن‌ها و فرایندهای اصلی بیولوژیکی ازجمله تکثیر سلولی، آپوپتوز و تمایز دارند. lncRNAها می‌توانند به‌طور بالقوه روی miRNAها، در جهت همسو و یا معکوس بر فعالیتشان تأثیر بگذارند تا از این طریق، نقش تنظیم‌کنندگی آن‌ها را تعدیل کنند. در این مطالعه، شبکه‌های ژنی mRNA-miRNA-lncRNA با استفاده از برنامه‌های آنلاین برای سه مارکر مسیر اکتودرمی (BMP4,NOG,FGF8) در سلول‌های بنیادی جنینی موشی ترسیم شد. مواد و روش ها: این مطالعه از نوع تئوریکال بیوانفورماتیکی است و micRNAهای هدف ژن‌های BMP4، NOG و FGF8 توسط پایگاه‌های داده‌ای MirWalk و TARGETSCAN استخراج و بررسی گردید تا درنهایت، بتوان miRNAهای مشترک این ۳ ژن را تهیه کرد؛ سپس از پایگاه داده‌ای DIANA-Tools، lncRNAهای هدف برای miRNAهای مشترک به‌دست آمد. یافته‌ها: ژن‌های mmu-miR-92a-2-5p، mmu-miR-129b-5p، mmu-miR-130b-5p، mmu-miR-692، mmu-miR-7009-3P، mmu-miR-7116-3p و mmu-miR-7689-3p ممکن است بر فعالیت lncRNA‌های Kcnq1ot1، Gm26812، Gm4117، Gm11837.4930423MO2Rik، Malat1، Gm12594، Gm3414.5830444B04Rik، Gm2464 و NEAT1 اثر بگذارند. بحث و نتیجه‌گیری: با توجه به ارتباط متقابل lncRNA، miRNA و mRNA، مطالعۀ ما یک نقش جدید از lncRNAها را برای تحقیقات آینده و مطالعات تجربی دربارۀ مسیر تمایز اکتودرمی و سازوکار‌های مولکولی فراهم می‌کند. SP - 29 EP - 41 AU - Moghaddam, Somayeh AU - Babaei, Esmaeil AD - Dept of Animal Biology, School of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran KW - Bioinformatics KW - Biological system KW - BM4 KW - Ectoderm KW - FGF8 KW - Non-coding RNAs UR - http://sjimu.medilam.ac.ir/article-1-7022-fa.html DO - 10.52547/sjimu.30.1.29 ER -