مقدمه: ویروس سینسیشیال تنفسی انسان(HRSV) مهم ترین عامل ویروسی عفونت های حاد تنفسی کودکان زیر ۵ سال در سرتاسر دنیا شناخته شده است. این ویروس عامل بروز ۵۰ درصد برونشیولیت و ۲۵ درصد پنومونی در نوزادان می باشد. با این وجود، اطلاعات اندکی در رابطه با ژنوتیپ های در حال گردش این ویروس در کشورهای در حال توسعه وجود دارد. از این رو، هدف این مطالعه بررسی ژنوتیپ های HRSV در سال های ۱۳۸۶و ۱۳۸۸ در ایران بوده است. مواد و روش ها: به ترتیب تعداد ۷۲ و ۱۰۷ نمونه تنفسی از کودکان کمتر از ۵ سال مبتلا به علایم حاد تنفسی در سال های ۱۳۸۶و ۱۳۸۸ از چندین شهر ایران جمع آوری و با استفاده از روش RT-PCR برای ژن گلیکوپروتئین G ویروسHRSV مورد آزمایش قرار گرفت. یافته های پژوهش: از تعداد ۷۲ نمونه تنفسی آزمایش شده در سال ۱۳۸۶، تعداد ۱۴ نمونه(۴۴/۱۹درصد) مثبت تشخیص داده شد که در ۳ ژنوتیپ از زیرگروه A قرار داشتند: ۱۲ سویه در ژنوتیپ GA۲، ۱ سویه در ژنوتیپ GA۱ و ۱ سویه در ژنوتیپ GA۵. در حالی که از ۱۰۷ نمونه تنفسی آزمایش شده در سال ۱۳۸۸، تعداد ۲۴(۴۴/۲۲ درصد) نمونه از لحاظ HRSVمثبت بودند که ۱۶ نمونه(۶۷ درصد) در زیرگروه A یعنی ۱۵ سویه در ژنوتیپGA۱ و ۱ سویه در ژنوتیپ GA۲ قرار گرفتند و ۸ نمونه (۳۴درصد) در زیرگروه B و ژنوتیپ BA طبقه بندی شدند. بحث و نتیجه گیری: این مطالعه گردش هم زمان چندین ژنوتیپ از ویروسHRSV را در سال های ۱۳۸۶و ۱۳۸۸ نشان داد. هم چنین یافته های ما شیوع بیشتر ژنوتیپ های زیرگروه A نسبت به زیرگروه B را نشان داد. در این مطالعه GA۲ و GA۱ به ترتیب ژنوتیپ های غالب در سال های ۱۳۸۶و ۱۳۸۸ بودند.