مقدمه: ویروس سینسیشیال تنفسی انسان(HRSV) مهم ترین عامل ویروسی عفونت های حاد تنفسی کودکان زیر 5 سال در سرتاسر دنیا شناخته شده است. این ویروس عامل بروز 50 درصد برونشیولیت و 25 درصد پنومونی در نوزادان می باشد. با این وجود، اطلاعات اندکی در رابطه با ژنوتیپ های در حال گردش این ویروس در کشورهای در حال توسعه وجود دارد. از این رو، هدف این مطالعه بررسی ژنوتیپ های HRSV در سال های 1386و 1388 در ایران بوده است. مواد و روش ها: به ترتیب تعداد 72 و 107 نمونه تنفسی از کودکان کمتر از 5 سال مبتلا به علایم حاد تنفسی در سال های 1386و 1388 از چندین شهر ایران جمع آوری و با استفاده از روش RT-PCR برای ژن گلیکوپروتئین G ویروسHRSV مورد آزمایش قرار گرفت. یافته های پژوهش: از تعداد 72 نمونه تنفسی آزمایش شده در سال 1386، تعداد 14 نمونه(44/19درصد) مثبت تشخیص داده شد که در 3 ژنوتیپ از زیرگروه A قرار داشتند: 12 سویه در ژنوتیپ GA2، 1 سویه در ژنوتیپ GA1 و 1 سویه در ژنوتیپ GA5. در حالی که از 107 نمونه تنفسی آزمایش شده در سال 1388، تعداد 24(44/22 درصد) نمونه از لحاظ HRSVمثبت بودند که 16 نمونه(67 درصد) در زیرگروه A یعنی 15 سویه در ژنوتیپGA1 و 1 سویه در ژنوتیپ GA2 قرار گرفتند و 8 نمونه (34درصد) در زیرگروه B و ژنوتیپ BA طبقه بندی شدند. بحث و نتیجه گیری: این مطالعه گردش هم زمان چندین ژنوتیپ از ویروسHRSV را در سال های 1386و 1388 نشان داد. هم چنین یافته های ما شیوع بیشتر ژنوتیپ های زیرگروه A نسبت به زیرگروه B را نشان داد. در این مطالعه GA2 و GA1 به ترتیب ژنوتیپ های غالب در سال های 1386و 1388 بودند.