[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 20، شماره 5 - ( ویژه نامه زمستان 91 1391 ) ::
جلد 20 شماره 5 صفحات 216-224 برگشت به فهرست نسخه ها
آنالیز داده های ژل های الکتروفورز دو بعدی با استفاده از روش های آماری چند متغیره
حکیمه زالی، مصطفی رضایی طاویرانی 1، علی صید خانی نهال، مهدی شهریاری نور، نازنین بلغاری
1- ، rezaei.tavirani@ibb.ut.ac.ir
چکیده:   (27895 مشاهده)
سابقه و هدف : در سـال های اخیـر تکنولـوژی مـربوط به تـوصــیف لکه های پروتئینی نمایان شده بر ژل های الکتروفورز دو بعدی، توسعه ی قابل ملاحظه ای یافته و نرم افزارهای متعدد آماری آنالیز ژل نیز ایجاد و گسترش یافته است که تأثیر این ابتکارات بر ارتقاء پروتئومیک بسیار چشمگیر است.آنالیز داده های عظیم پروتئومیکی با دارا بودن متغیر های زیاد نیاز به روش های چند متغیره است که امکان آنالیز آماری همزمان چندین متغیر را فراهم می کنند. در این مطالعه فرآیند تمایز و پیری سلولی از سلول های بنیادی تا آستروسیت توسط پروتئومیکس مورد بررسی قرار گرفته و کاربردهای آماری نرم افزار های آنالیز ژل مورد توجه قرار گرفت. مواد و روشها : پروتئوم چهار گروه آزمایشی ( سلول های بنیادی، آستروسیت جوان ، آستروسیت با تمایز متوسط و آستروسیت پیر) توسط نرم افزار spots Progenesis Same مورد مطالعه آماری قرار گرفت . آنالیز خوشه بندی ،آنالیز مولفه اصلی و آنالیز Power در بررسی گروه های آزمایشی مورد استفاده قرار گرفت. یافته و بحث : در آنالیز بیوانفورتیکی و آماری ژل های بدست آمده از تکنیک الکتروفورز دو بعدی 940 نقطه پروتئینی با تغییر بیان معنی دار (p<0.05)در چهار گروه مشاهده شد که مقایسه بین گروه ها حکایت از بیان پروتئینهای جدید و خاموشی برخی از پروتئین ها در مسیر های سیگنالینگ تمایز و پیری سلولی است.آنالیز خوشه بندی، پروتئین ها را از نظر بیان به 2 خوشه اصلی تقسیم نمود که بیانگر وجود پروتئین هایی با بیان مشابه در هر خوشه است که این پروتئین ها می توانند عملکرد مشابهی را در شرایط آزمایش ارائه نمایند یا بیانگر حضور همه آن ها در مسیر بیولوژیکی مشترکی است . آنالیز PCA نتایج حاصل از خوشه بندی را تایید نمود و نشان داد که داده های پروتئینی بر طبق شرایط آزمایش خوشه-بندی شده است. در نهایت می توان نتیجه گرفت که با کمک نرم افزار ،آنالیز آماری به سادگی و با سرعت انجام شد و تغییرات بیان معنی دار ناشی از تمایز و پیری در سطح پروتئوم با آنالیزهای آماری خوشه بندی و PCA به خوبی مورد بررسی قرار گرفت و شاخص های تغییرات مشخص شد.
واژه‌های کلیدی: ژل الکتروفورز دو بعدی، روش آماری چند متغیره، پروتئین
متن کامل [PDF 1204 kb]   (3078 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: میکروب شناسی پزشکی
دریافت: ۱۳۹۱/۱۲/۲۸ | پذیرش: ۱۳۹۲/۳/۲۶ | انتشار: ۱۳۹۲/۳/۲۶
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA code


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

zali H, rezaee tavirani M, seied khani nahal A, shahriari noor M, bolghari N. Data Analysis of Two Dimensional Electrophoresis Gels by Multivariate Statistical Methods. sjimu. 2013; 20 (5) :216-224
URL: http://sjimu.medilam.ac.ir/article-1-947-fa.html

زالی حکیمه، رضایی طاویرانی مصطفی، صید خانی نهال علی، شهریاری نور مهدی، بلغاری نازنین. آنالیز داده های ژل های الکتروفورز دو بعدی با استفاده از روش های آماری چند متغیره . مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی ایلام. 1391; 20 (5) :216-224

URL: http://sjimu.medilam.ac.ir/article-1-947-fa.html



دوره 20، شماره 5 - ( ویژه نامه زمستان 91 1391 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله علمی پزوهشی دانشگاه علوم پزشکی ایلام scientific journal of ilam university of medical sciences
Persian site map - English site map - Created in 0.24 seconds with 31 queries by YEKTAWEB 3781