[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 23، شماره 3 - ( 6-1394 ) ::
جلد 23 شماره 3 صفحات 97-108 برگشت به فهرست نسخه ها
بررسی کموانفورماتیکی و اندازه گیری فعالیت آزمایشگاهی لیگاندهای ممانعت کننده آنزیم سیکلواکسیژناز دو Cox2 انسانی
سیده فاطمه موسوی1، علی رمضانی2، پرویز اشتری3، فاطمه کشاورزی 4
1- دانشگاه آزاد اسلامی، واحد سنندج
2- دانشگاه علوم پزشکی زنجان
3- پژوهشگاه علوم و فنون هسته‌ای
4- استادیار دانشگاه آزاد اسلامی، واحد سنندج ، gol.keshavarzi@gmail.com
چکیده:   (3124 مشاهده)
مقدمه: مهار‌کننده‌ های انتخابی آنزیم سیکلو‌اکسیژناز دو، نظیر سلوکو‌کسیب، روفوکوکسیب و والدوکسیب اخیراً به عنوان کاهنده‌ های پاسخ‌ های التهابی به کار می ‌روند، با وجود این هنوز به مطالعات و تحقیقات بیشتری در زمینه مهار‌کننده‌ های انتخابی Cox2 نیاز است. این مطالعه در راستای معرفی ساختار‌های جدید با میل تر‌کیبی بیشتر به آنزیم Cox2 می ‌‌‌باشد.
مواد و روش ها: سا‌ختار‌های شیمیا‌یی با 80 درصد شباهت به سلو‌کو‌کسیب، از Pubchem در پایگاه اطلاعا‌تی NCBI استخراج و جمع ‌‌آوری شد. فایل PDB آنزیم Cox2 (6COX) را د‌ر حا‌لت پیوند با لیگا‌ند SC-558 به عنوان لیگاند مرجع، از سایت RCSB PDB به دست آمد. د‌اکینگ لیگا‌ند‌ها به جایگاه اتصال SC-558 را با استفاد‌ه از نرم افزار FlexX, Lead IT اجرا شد و انرژی میان کنش‌ های بین ترکیبات مختلف به دست آمد. مقدار IC50 ترکیبات مورد نظر با استفاده از روش غربالگری آزمایشگاهی، بر علیه آنزیم Cox2 تعیین شد. سرانجام با استفاده از روش سنجش MTT‌، میزان سمیت سلولی ترکیبات مورد نظر تعیین شد.
یافته های پژوهش: نتیجه غربالگری در پایگاه داده Pubchem، 5000 مولکول مشابه سلوکوکسیب بود. 24 تا از ترکیبات امتیاز‌های انرژی بهتری نسبت به 6COX باند شده با SC-558 داشتند. لیگاند‌ها به پاکت پیو‌ند‌ی داک شد‌‌ند که با سرین 353، آلانین 527، وا‌لین 523، متیونین 522، فنیل آلانین 518 و لوسین 352 میان کنش نشان د‌اد‌ند. با بررسی چشمی، ترکیبات جهتگیری و حالت پیوندی مشابه با SC-558 نشان داد‌‌ند.
 بحث و نتیجه گیری: یافته ‌های ما، رویه محاسباتی کشف ترکیبات جدید ضدالتهابی با فعالیت بیشتر و سمیت کمتر نسبت به مهارکننده‌ های عمومی Cox2 را قوت بخشید.
واژه‌های کلیدی: آنزیم سیکلو‌اکسیژناز دو، مهار‌کننده انتخابی سیکلو‌اکسیژناز دو، داکینگ، روش سنجش MTT
متن کامل [PDF 773 kb]   (873 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: بیوشیمی
دریافت: ۱۳۹۳/۶/۲۶ | پذیرش: ۱۳۹۳/۱۱/۱۹ | انتشار: ۱۳۹۴/۷/۶
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

کد امنیتی را در کادر بنویسید >


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Mousavi S F, Ramezani A, Ashtari P, keshavarzi F. Chemo-Informatics Evaluation and Invitro Bioactivity Mesurment of Human Cox2 Enzyme Inhibitors Ligands. sjimu. 2015; 23 (3) :97-108
URL: http://sjimu.medilam.ac.ir/article-1-2129-fa.html

موسوی سیده فاطمه، رمضانی علی، اشتری پرویز، کشاورزی فاطمه. بررسی کموانفورماتیکی و اندازه گیری فعالیت آزمایشگاهی لیگاندهای ممانعت کننده آنزیم سیکلواکسیژناز دو Cox2 انسانی . مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی ایلام. 1394; 23 (3) :97-108

URL: http://sjimu.medilam.ac.ir/article-1-2129-fa.html



دوره 23، شماره 3 - ( 6-1394 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله علمی پزوهشی دانشگاه علوم پزشکی ایلام scientific journal of ilam university of medical sciences
Persian site map - English site map - Created in 0.24 seconds with 31 queries by YEKTAWEB 3705