[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 21، شماره 2 - ( خرداد 92 1392 ) ::
جلد 21 شماره 2 صفحات 92-102 برگشت به فهرست نسخه ها
آنالیز بیان ژن داده های ماکرواری بیماری لوکمیا با برنامه DAVID
حکیمه زالی 1، راضیه امینی، رضا شیری هریس
1- ، Hakimehzali@yahoo.com
چکیده:   (12740 مشاهده)
چکیده مقدمه: سرطان خون یا لوکمیا بیماری پیشرونده و بدخیم اعضای خون ساز بدن است. ناهنجاری ‌های ژنتیکی نقش بسیار مهمی در رشد لوکمی در بدن دارد. مطالعات زیادی پیرامون کشف عوامل ملکولی درگیر در این بیماری صورت گرفته است یکی از حوضه های دانش جدید در کشف بیان ژن ها در حالت بیماری استفاده از تکنولوژی ماکرواری است که یک تصویر کلی از میزان بیان ژن را در سایز بزرگ ژنومی ارائه می کند. در واقع با بررسی تعداد زیادی ژن در کنار یکدیگر انتظار می رود تغییرات حاصل از بیماری را دقیق تر بتوان در علم بیولوژیک مورد بررسی قرار داد. در این مطالعه داده های حاصل از ماکرواری بیماری لوکمیا توسط برنامه DAVID مورد آنالیز قرار می گیرد و هدف آن انجام آنالیز های عملکردی بر روی لیست های ژنومی و پروتئومی که داده های آن ها از مطالعات بیولوژیک با دستگاه های پیشرفته(high-throughput) حاصل می شود. مـــواد و روش هـــا: ســـت ژنـــی مـــاکــــــرواری لـــوکـــمـــیـــا از پـــایــــــگـــاه داده http://www.biomedcentral.com/content/supplementary/1471- به دست آمد و با تجزیه و تحلیل یافته ها با نرم افزارهای بیوانفورماتیکی(DAVID)، ارتباطات بیان ژن در قالب کلاس های مختلف ژنی، چارت ها و خوشه بندی ژن ها مورد بررسی قرار گرفت. یافته های پژوهش: لیست ژن های شناسایی شده در میکرواری با برنامه DAVID تهیه شد. از 615 ژن شناسایی شده ارتباط با کلاس بیماری های مختلـــف شناســـایی شد. بیشترین ژن های دخیل در بیماری در دسته ژن هایی هستند که در انواع سرطان ها دخالت دارند. 7/23 درصد ژن های شناسایی شده(146 ژن) در بیماری لوکمیا در دسته ژن های موجود در انواع سرطان ها هستند. از 615 ژن شناسایی شده 70 چارت مسیرهای بیولوژیکی(موجود در پایگاه داده KEGG) مرتبط با بیماری شناسایی شد. از 615 ژن شناسایی شده 12 کلاستر بر اساس حاشیه نویسی عملکردی مرتبط با بیماری شناسایی شد. بحث و نتیجه گیری: نتایج نشان می دهد که برنامه آنالیز ژنوم DAVIDقادر است کلاس های مهم ژنی و مسیرهای اصلی درگیر در بیماری را تعیین نماید و بهترین کاندیدا مارکر ژنی برای تشخیص بیماری، علت آن و درمان لوکمیا را معرفی نماید.
واژه‌های کلیدی: ماکرواری، بیماری لوکمیا، برنامه DAVID، بیان ژن
متن کامل [PDF 682 kb]   (2115 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي | موضوع مقاله: میکروبشناسی
دریافت: ۱۳۹۲/۵/۹ | پذیرش: ۱۳۹۲/۵/۱۵ | انتشار: ۱۳۹۲/۶/۱۰
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA code


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

zali H, amini R, shiri haris R. Gene Expression Analysis of Leukemia Microarray Data By DAVID Program. sjimu. 2013; 21 (2) :92-102
URL: http://sjimu.medilam.ac.ir/article-1-1114-fa.html

زالی حکیمه، امینی راضیه، شیری هریس رضا. آنالیز بیان ژن داده های ماکرواری بیماری لوکمیا با برنامه DAVID . مجله علمی دانشگاه علوم پزشکی ایلام. 1392; 21 (2) :92-102

URL: http://sjimu.medilam.ac.ir/article-1-1114-fa.html



دوره 21، شماره 2 - ( خرداد 92 1392 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله علمی پزوهشی دانشگاه علوم پزشکی ایلام scientific journal of ilam university of medical sciences
Persian site map - English site map - Created in 0.25 seconds with 31 queries by YEKTAWEB 3753